由于硅藻土独特的微观结构，使得其在建材、化工、农业、环保、食品、高新技术等很多领域有着广泛的应用价值。在日本，硅藻土的21%用于建筑材料工业，11%用于耐火材料，33%用于载体、填料，目前日本将其在新型建筑材料上的开发应用已取得很好效果。
概括起来硅藻土的应用主要有：
(1)利用其微孔结构制备各种助滤剂材料和催化剂载体。这是硅藻土的主要用途之一。它充分利用了硅藻土的微观结构特性。但作为制备助滤剂的硅藻土矿以富含园筛藻的为好，而作为催化剂载体以直链藻结构的硅藻土矿为好，因为直链藻有非常大的内表面。
(2)制备保温耐火材料。在900℃以下的保温材料中，硅藻土保温耐火砖是最理想的选择，这也是我国硅藻土矿的主要应用领域之一。
(3)硅藻土可以作为活性SiO2的主要原料来源。由于硅藻土中的SiO2是无定形的，所以具有较高的反应活性，如利用其与钙质原料反应制备硅钙板防火材料是非常理想的。当然对低品位的硅藻土矿要除去其中的部分杂质。
(4)利用其微孔吸附特性制备抗菌、防霉剂。这也是硅藻土新的重要应用之一，这是一种功能材料，其具有生态效应。杆菌的长度一般为1-5um,球菌的直径为0.5-2um，而硅藻土的孔径在0.5um,故用硅藻土制成的滤芯可以除去细菌，若在硅藻土滤芯中再附上抗菌剂、光敏剂，则除菌、杀菌效果会更好，而且可以制成抗菌剂添加到其他材料中,并达到缓释长效的目的 。现在，人们可以 利用高技术手段，以硅藻土为载体，制备出更加高效的硅藻土型防霉抗菌功能材料。
吉林远通矿有限公司技术中心现拥有员工42名，从事硅藻土开发、研究的高中级职称专业技术人员18名，拥有国内外先进的硅藻土专项检测仪器20余台套，检测项目包括硅藻土产品的结晶硅含量、SiO2、A12O3、Fe2O3、TiO2等化学成份;产品颗粒分布、白度、渗透率、饼密度、筛余物等;食品安全要求的铅、砷等微量重金属元素，可溶性铁离子、可溶性铝离子、PH值等项目检测。
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